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for query gene Pfl01_5357 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  796    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2184  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3588  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  50.84 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1805  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0668559  normal  0.16221 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.64 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  31.03 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.44 
 
 		 392 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.2 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.35 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.78 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.76 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.32 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  29.57 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.72 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.86 
 
 		 407 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.18 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  31.55 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.94 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  26.49 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.95 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.42 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.18 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.59 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.29 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  29.33 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.81 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  27.89 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.03 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.76 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.81 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.18 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.03 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
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NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.8 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.69 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.24 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  26.74 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.81 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
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NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  28.5 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.82 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  28.01 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
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NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  27.59 
 
 		 386 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.82 
 
 		 409 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  29.97 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.69 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.07 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  28.69 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.58 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.61 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.58 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.51 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.22 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.58 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.86 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  26.29 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.36 
 
 		 408 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  28.5 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.43 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  25.93 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.87 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3182  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.32 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.23 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.39 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01631  predicted transporter  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  26.53 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.37 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  28.5 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  27.37 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  28.24 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  25.73 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II1915  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.5 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  28.24 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.34 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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