More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1805 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1805  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0668559  normal  0.16221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3588  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  57.73 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2184  major facilitator transporter  57.77 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5357  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0210588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.28 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 425 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.3 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  27.06 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  26.01 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.32 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.05 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.75 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.14 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.75 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
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NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.89 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.86 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.36 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.16 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.13 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.94 
 
 		 400 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  26.12 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.55 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.27 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.16 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.78 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  27.76 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.48 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.32 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  26.22 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  24.64 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.82 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.59 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.36 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  27.49 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  25.75 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.2 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.78 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.59 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27.95 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.48 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.75 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.13 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.81 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  27.1 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1858  inner membrane transport protein YdhC  25.53 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141458  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.75 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  25.65 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.22 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.75 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.36 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1980  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00451664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1700  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.77 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.96 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  25.61 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1537  inner membrane transport protein YdhC  25.61 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0900835  normal  0.0201427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.19 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.65 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  28.32 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.07 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.3 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.25 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  26.96 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1367  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.81 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.07 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.48 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.25 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  25.3 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.84 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.1 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
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NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.34 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.54 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.48 
 
 		 424 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.85 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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