More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2112 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  788    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  51.6 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 381 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.7 
 
 		 421 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  29.77 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  24.38 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  24.32 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  29.76 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  24 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 415 aa  89.4  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  33.97 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.73 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  24.51 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  27.62 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  27.88 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  24.42 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  31.18 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  32.34 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.29 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  29.27 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.51 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  23.67 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.31 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.01 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  27 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  27 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.34 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  26.9 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2574  inner membrane transport protein YdhC  25.78 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  23.56 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.18 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1787  inner membrane transport protein YdhC  24.12 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  23.56 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.49 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  23.56 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 523 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  22 
 
 		 358 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 500 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1859  inner membrane transport protein YdhC  25.78 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.52 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1753  inner membrane transport protein YdhC  25.78 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000133845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.73 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.19 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>