More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2615 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  810    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 408 aa  512  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  49.07 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  30.33 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  26.3 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  28.13 
 
 		 392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.05 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.38 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.56 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 383 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  32.69 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  24.86 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  31.71 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  30.45 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  31.76 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.43 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  21.36 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 477 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  21.98 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.73 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.89 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  30.1 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.55 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  23.17 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.97 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  24.92 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.47 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  27.96 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  30.73 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  30.81 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.98 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  28.88 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>