138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1289 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 398 aa  772    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  31.82 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  29.52 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  29.51 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  30.13 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  28.82 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  29.21 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  32.63 
 
 		 332 aa  130  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  25.58 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  25.36 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  27 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.15 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  32.23 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.55 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25.55 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.55 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  22.02 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.55 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 516 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  24.7 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.75 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  27.69 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  21.88 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.29 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 517 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 575 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  27.41 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.39 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.1 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  32.29 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.2 
 
 		 478 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.01 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  26.35 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  27.8 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  25.9 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  26.9 
 
 		 458 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.04 
 
 		 401 aa  46.2  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  29.48 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  26.61 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  24.05 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  21.11 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  22.31 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>