71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3218 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  100 
 
 		 385 aa  750    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.02 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.63 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  24.23 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  24.63 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  26.65 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  23.66 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  23.38 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  22.25 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.72 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  24.48 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.07 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  23.35 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000669622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  22.04 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  25.56 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  20.97 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  21.64 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  17.91 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 466 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  19.05 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  22.29 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.03 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.15 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.16 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 500 aa  43.5  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 447 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.96 
 
 		 520 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  26.32 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  23.63 
 
 		 480 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 527 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>