More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1279 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  96.54 
 
 		 462 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  100 
 
 		 462 aa  900    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0128  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0123  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0178654  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0578  transporter, major facilitator family protein  29.69 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.199394 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0580  transporter, major facilitator family protein  27.85 
 
 		 481 aa  182  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  26.18 
 
 		 463 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  26.18 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  25.94 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  25.85 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4221  tetracycline resistence protein, metal-tetracycline/H+ antiporter  27.34 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4574  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4380  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000603608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4718  major facilitator family transporter  27.34 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  27.08 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  31.8 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  24.55 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.69 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.92 
 
 		 474 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.89 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.54 
 
 		 539 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.18 
 
 		 531 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.64 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.83 
 
 		 512 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.7 
 
 		 524 aa  90.1  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.25 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.88 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.82 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.69 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.34 
 
 		 505 aa  86.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.21 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  23.33 
 
 		 457 aa  86.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.58 
 
 		 483 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  24.64 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.08 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.08 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  23.79 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  22.08 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  22.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.25 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.21 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  25.6 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.27 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.94 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.74 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.55 
 
 		 521 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  23.13 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.74 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.35 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.31 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  19.76 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.62 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.72 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  23.41 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  24.75 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.67 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.67 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  23.17 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.17 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.72 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_0854  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204372  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.17 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
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NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.38 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.77 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.72 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.72 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.17 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  24.8 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.71 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  23.51 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  22.1 
 
 		 683 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.6 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  25.62 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.62 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
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