202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0580 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0580  transporter, major facilitator family protein  100 
 
 		 481 aa  950    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0578  transporter, major facilitator family protein  66.3 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.199394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  27.85 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  27.09 
 
 		 462 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0123  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0128  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 463 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  24.02 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  24.02 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  23.77 
 
 		 463 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.23 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.23 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.97 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.28 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4380  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000603608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4718  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4574  major facilitator family transporter  23.84 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.49 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.23 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  23.4 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4221  tetracycline resistence protein, metal-tetracycline/H+ antiporter  24.21 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.71 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  23.12 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.02 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  25 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  25.44 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0854  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.35 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  21.02 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  23.39 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.12 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.68 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  22.94 
 
 		 571 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.4 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 589 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.96 
 
 		 478 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.96 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.96 
 
 		 478 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1383  arabinose efflux permease-like  26.8 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0240846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  24.09 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 467 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 596 aa  53.5  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.37 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  23.97 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.67 
 
 		 613 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.17 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.71 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.97 
 
 		 537 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.73 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.73 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.36 
 
 		 565 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.41 
 
 		 489 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.74 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 504 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  19.13 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.22 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  24.72 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.47 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  21.63 
 
 		 467 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.51 
 
 		 530 aa  50.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.96 
 
 		 528 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.73 
 
 		 525 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  23.16 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.15 
 
 		 533 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.55 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  20.61 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.96 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.58 
 
 		 534 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.24 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.05 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.21 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  19.96 
 
 		 524 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  21.68 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  22 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>