136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0578 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0578  transporter, major facilitator family protein  100 
 
 		 467 aa  913    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.199394 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0580  transporter, major facilitator family protein  66.3 
 
 		 481 aa  629  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  30.4 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  29.69 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0123  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0128  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  26.24 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  25.99 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4221  tetracycline resistence protein, metal-tetracycline/H+ antiporter  23.59 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4380  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000603608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4718  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4574  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4590  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4624  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0497223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  23.91 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.89 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  24.06 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  24.89 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.73 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.93 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  24.43 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.63 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.59 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.11 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.61 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.63 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.66 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.3 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  23.91 
 
 		 519 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.05 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.43 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  22.2 
 
 		 519 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.3 
 
 		 512 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.87 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.97 
 
 		 474 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.33 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.65 
 
 		 526 aa  53.9  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.58 
 
 		 509 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.3 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 503 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.5 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  23.69 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.2 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.2 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.09 
 
 		 613 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 523 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 518 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.61 
 
 		 513 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.19 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0854  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.34 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.09 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.29 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.31 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.07 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.74 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  25.13 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.29 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.31 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.34 
 
 		 486 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 589 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.71 
 
 		 565 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.98 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.14 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.93 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 498 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 560 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.17 
 
 		 538 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 520 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>