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for query gene Tcur_0278 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 467 aa  867    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4115  major facilitator transporter  49.57 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.976029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.23 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1065 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  42.2 
 
 		 1048 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1939  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 477 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0155  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.31 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.67 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 489 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.24 
 
 		 489 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 		 487 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.59 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 607 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 522 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.03 
 
 		 646 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1215  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 463 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 		 510 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 468 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.87 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 468 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 490 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  29.21 
 
 		 582 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 585 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  28.93 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  28.68 
 
 		 582 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.89 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  28.96 
 
 		 582 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.86 
 
 		 492 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.12 
 
 		 475 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.2 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.03 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 532 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.41 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  33.02 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.9 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 502 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.33 
 
 		 467 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 480 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 		 763 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.66 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 540 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 		 507 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 474 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 468 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  30.97 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 		 472 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  32.99 
 
 		 508 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.96 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  35.13 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 564 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 520 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.32 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.472299  hitchhiker  0.00171027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  37.44 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
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NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  36.39 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 452 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 		 480 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 490 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.42 
 
 		 497 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
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NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
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NC_007925  RPC_3498  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699034  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
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NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 541 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
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