More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0155 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0155  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
487 aa  897    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086904  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  40.64 
 
 
1065 aa  259  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.88 
 
 
531 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0658046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  39.09 
 
 
1048 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1939  major facilitator transporter  36.99 
 
 
477 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  0.576775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4115  major facilitator transporter  37.21 
 
 
468 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0278  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.7 
 
 
489 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
522 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
512 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
509 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 
520 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
505 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
524 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
504 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
540 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 
502 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 
521 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
646 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
646 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.96 
 
 
646 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 
609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 
528 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
502 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 
532 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
564 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 
488 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 
465 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  36.38 
 
 
457 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 
485 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 
468 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.11 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 
508 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 
522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
492 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 
763 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 
579 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 
527 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
493 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.43 
 
 
487 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
471 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 
522 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 
534 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28 
 
 
492 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28 
 
 
492 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  35.78 
 
 
486 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 
492 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 
543 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28 
 
 
492 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.1 
 
 
476 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.15 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.15 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28 
 
 
513 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  29.22 
 
 
561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.86 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  27.76 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  33.25 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 
627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  31.87 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  34.72 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 
537 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
518 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  31.56 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 
507 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 
570 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  35.35 
 
 
492 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  34.62 
 
 
555 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
500 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 
452 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
483 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
521 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 
541 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 
520 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
515 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.8 
 
 
532 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.69 
 
 
487 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
607 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
500 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 
480 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 
519 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 
458 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 
489 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  32.2 
 
 
530 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
486 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
486 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
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