More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1088 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 446 aa  861    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  42.54 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  37.96 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  36.1 
 
 		 471 aa  276  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 461 aa  275  8e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.09 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  36.77 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  34.99 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  34.03 
 
 		 485 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  35.09 
 
 		 449 aa  220  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0456  major facilitator superfamily permease  30.04 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0937  major facilitator superfamily permease  32.18 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.343736  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.33 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.46 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 491 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.46 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.2 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  31.48 
 
 		 480 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 483 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  31.23 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 		 489 aa  176  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.04 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  31.67 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.69 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 561 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  32.45 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.32 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  33.33 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  28.89 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  31.65 
 
 		 683 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 570 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 564 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.93 
 
 		 492 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  28.75 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 		 635 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28.75 
 
 		 492 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 658 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.99 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.24 
 
 		 492 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.17 
 
 		 513 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  28.29 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 523 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  29.09 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.46 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 558 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  29.98 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 534 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 620 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 643 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 643 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.16 
 
 		 541 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  29.06 
 
 		 542 aa  139  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 		 502 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0998  putative permease  28.1 
 
 		 548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
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NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 599 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.28 
 
 		 599 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
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NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  29.95 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.95 
 
 		 599 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
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NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  29.7 
 
 		 599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  24.94 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_23660  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.35 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.629317  normal  0.503051 
 
 
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NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.44 
 
 		 599 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.44 
 
 		 599 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.2 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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