More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0280 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0280  major facilitator transporter  100 
 
 		 466 aa  928    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040332  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0937  major facilitator superfamily permease  44.42 
 
 		 463 aa  339  8e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.343736  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0290  major facilitator superfamily permease  38.91 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.146864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1628  major facilitator superfamily permease  38.6 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1088  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1853  major facilitator superfamily permease  35.17 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  31.67 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  36.23 
 
 		 449 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0049  sugar efflux permease  31.58 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0360  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1471  major facilitator superfamily permease  34.91 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 485 aa  217  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0456  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 465 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1003  lincomycin resistance protein LmrB  30.49 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  30.49 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  29.62 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.06 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 570 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1468  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.986472  normal  0.151461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.28 
 
 		 658 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.38 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 		 635 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  28.71 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.64 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 482 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  28.95 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  29.4 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0888  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.01 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0988  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.1 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.98 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1115  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.85 
 
 		 491 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 492 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  28.22 
 
 		 492 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1028  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.35 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10576e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.12 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.74 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  27.98 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4325  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.35 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  26.65 
 
 		 683 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 643 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 643 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 524 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08630  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2756  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  26.75 
 
 		 503 aa  153  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  30.53 
 
 		 599 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  30.53 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.94 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.53 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 599 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 579 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 		 505 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.28 
 
 		 599 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.28 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.28 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
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NC_004116  SAG1707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 499 aa  150  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00395265  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_1383  major facilitator superfamily permease  28.43 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.601618  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 657 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.77 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 558 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5520  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  26.82 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.5 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.45 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 		 539 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_14700  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 491 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0438074  normal  0.116411 
 
 
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