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for query gene Gobs_0854 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0854  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  817    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0748  hypothetical protein  36.89 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.38 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.81 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.14 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.64 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 502 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.65 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.53 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 528 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  32.29 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 678 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.17 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 575 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1490  putative tetracycline resistance protein  22.25 
 
 		 462 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000919322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 682 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 682 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 682 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  29.03 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 522 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.98 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 519 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 525 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 553 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 512 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 487 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 548 aa  93.2  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  31.03 
 
 		 498 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 534 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 566 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.19 
 
 		 504 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  28.5 
 
 		 530 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 500 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0155  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 487 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 512 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1279  tetracycline resistance protein, putative  21.73 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000123151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  32.91 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  30.09 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.97 
 
 		 522 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  27.43 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  27.43 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 676 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 562 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 569 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 593 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 680 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 592 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0244  major facilitator superfamily permease  25.53 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00531035  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_23370  arabinose efflux permease family protein  29.74 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.517259  normal  1 
 
 
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