More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3069 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
504 aa  999    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  55.26 
 
 
510 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  51.38 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  45.25 
 
 
514 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.97 
 
 
587 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  46.43 
 
 
582 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  46.48 
 
 
553 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
521 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  45.34 
 
 
518 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  44.93 
 
 
519 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.99 
 
 
532 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  45.66 
 
 
523 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 
469 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 
516 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 
574 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 
522 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.15 
 
 
522 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 
505 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.26 
 
 
543 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.68 
 
 
519 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  42.95 
 
 
334 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  42.95 
 
 
334 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  42.95 
 
 
334 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 
478 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 
527 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 
478 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 
478 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 
484 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 
478 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.11 
 
 
529 aa  203  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
522 aa  203  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  33.61 
 
 
537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.2 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.02 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.65 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.14 
 
 
478 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.85 
 
 
467 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.31 
 
 
500 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
502 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.3 
 
 
525 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 
504 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  29.81 
 
 
521 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 
489 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  29.98 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.92 
 
 
512 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  32.3 
 
 
528 aa  190  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
508 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.67 
 
 
512 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  29.91 
 
 
512 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.75 
 
 
512 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30.75 
 
 
512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.83 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30.75 
 
 
512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.83 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 
488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.37 
 
 
489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.77 
 
 
476 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 
532 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.91 
 
 
519 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 
471 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
458 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
502 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
528 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 
458 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
500 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
507 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 
478 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  31.81 
 
 
469 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 
485 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
525 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 
458 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 
511 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
513 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 
541 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.55 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  33.08 
 
 
492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.24 
 
 
486 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
463 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 
520 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 
482 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
498 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
532 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.79 
 
 
524 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  32.37 
 
 
506 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 
500 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  29.21 
 
 
518 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  31.12 
 
 
502 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>