25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0306 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 384 aa  756    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 396 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000874493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  25.8 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  25.15 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  22.65 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  24.15 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  22.19 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  27.91 
 
 		 655 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25.06 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.3 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  25.44 
 
 		 465 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>