216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0180 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  91.79 
 
 		 414 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  800    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  31.81 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  28.12 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  28.68 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  21.78 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  22.89 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  23.76 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.14 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  21.88 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  20.59 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  24.92 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  23.93 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  24.67 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  24 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  22.47 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  23.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  23.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  23.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  23.56 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  23.32 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  47.14 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  24.23 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.74 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  31.37 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  23.17 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  30.07 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  30.05 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  28.47 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  22.95 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2523  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 551 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  30.33 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  22.54 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 526 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2926  multidrug transporter, putative  29.21 
 
 		 519 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0138273  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>