170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001064 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  100 
 
 		 401 aa  809    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  44.57 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  41.42 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  41.62 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  38.54 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  22.84 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  23.56 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  23.56 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  23.56 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  23.56 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  23.84 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.24 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  33.86 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  25.36 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  33.61 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  33.61 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  33.61 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  33.61 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  33.61 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  29.06 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  27.49 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  24.1 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.12 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  27.01 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  28.49 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.73 
 
 		 521 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 529 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  20.84 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  23.8 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  19.88 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  26.44 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 		 466 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 490 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  27.97 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.48 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  25.85 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 506 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  25.95 
 
 		 217 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  20.34 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  25 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 404 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  25.51 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.3 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>