269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3138 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 385 aa  735    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  48.88 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  40.82 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  46.37 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  45.68 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  38.44 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.47 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.64 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  23.47 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.81 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  22.79 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.04 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  22.79 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  27.09 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  31.98 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  31.58 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  30.69 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  41.57 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  33.56 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  33.56 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 476 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  33.56 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  26.61 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 391 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 430 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  29.09 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  30.28 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  32.97 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  33.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  25.68 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.68 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  35.79 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 565 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  28.03 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  35.79 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3691  putative transmembrane efflux protein  37.88 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.51 
 
 		 543 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 491 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>