More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3691 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3691  putative transmembrane efflux protein  100 
 
 
459 aa  862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
487 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1566  major facilitator superfamily protein  39.15 
 
 
481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.63 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 
502 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.17 
 
 
508 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 
763 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 
498 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 
489 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.41 
 
 
490 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 
490 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 
478 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 
458 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
646 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 
646 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.19 
 
 
463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.06 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.06 
 
 
468 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
487 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
478 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 
553 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  33.66 
 
 
468 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 
788 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.17 
 
 
458 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  33.18 
 
 
469 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 
475 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
504 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.6 
 
 
397 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
483 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.57 
 
 
627 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  33.09 
 
 
475 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  32.9 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.06 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.35 
 
 
467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 
484 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 
478 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 
480 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 
509 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 
493 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.95 
 
 
466 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
504 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 
452 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 
512 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 
583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  35.28 
 
 
482 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.81 
 
 
505 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 
534 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 
527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 
498 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  34.33 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  32.67 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 
508 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  32.69 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  32.56 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
507 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 
488 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 
502 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 
482 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  31.28 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.03 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.93 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  34.11 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 
534 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 
489 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
465 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  35.1 
 
 
500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 
520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  30.9 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  30.37 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
520 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
518 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
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NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 
500 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
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