107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 430 aa  780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  38.66 
 
 		 690 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  37.24 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  34.94 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  40.88 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  34.48 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  30.68 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.5 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  25.56 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  25.23 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 444 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  23.08 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  26.98 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  27.65 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.58 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  27.99 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  23.97 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  30.77 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  31.29 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  31.36 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.23 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  25 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26.64 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.64 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  27.01 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  27.01 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  27.01 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  27.01 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  30.3 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  18.42 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 520 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 397 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  24.56 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>