185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0688 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0688  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 411 aa  775    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1789  Necrosis inducing  47.31 
 
 		 690 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 405 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3164  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.761338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3049  major facilitator superfamily transporter  45.34 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128877  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0799  major facilitator superfamily MFS_1  49.19 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.330646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02380  arabinose efflux permease family protein  40.26 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  44.13 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33850  Major Facilitator Superfamily transporter  37.6 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.150605  normal  0.501617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09410  arabinose efflux permease family protein  34.15 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02270  Major Facilitator Superfamily transporter  31.12 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.6 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  27.03 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.8 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  26.64 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.64 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.94 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.48 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.64 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.64 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.64 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  20.76 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  20.76 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  20.42 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  20.76 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  20.42 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.82 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  20.42 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  19.63 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.82 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  23.69 
 
 		 402 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  20.72 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  27.92 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.01 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.16 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.32 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  21.56 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  22.16 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  32.2 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.16 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  21.56 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  31.43 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.19 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.02 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>