153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5283 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5283  major facilitator transporter  100 
 
 		 515 aa  969    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280334  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  30.54 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  27.9 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  28.77 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 395 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 421 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 413 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  28.03 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  32.03 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  32.67 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  35.51 
 
 		 426 aa  51.6  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  30.72 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 458 aa  50.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 406 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 367 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1601  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0564128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  32.23 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  32.23 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  30.26 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0644  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.592278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 438 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 414 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.46 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 466 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 394 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 462 aa  47  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  37.37 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.5 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2827  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.72 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  19.46 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  25.82 
 
 		 683 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  27.67 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  27.54 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  27.54 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  27.54 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>