More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2963 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
380 aa  729    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  76.86 
 
 
382 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  42.16 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2594  major facilitator transporter  38.4 
 
 
395 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  29.68 
 
 
382 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
388 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  33.14 
 
 
392 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  26.37 
 
 
389 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  30.18 
 
 
410 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  30.71 
 
 
403 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
401 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
408 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 
406 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
402 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  29.24 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  26.99 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  28.54 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  27.16 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
408 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
371 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  29.41 
 
 
422 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
399 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 
431 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  28.98 
 
 
410 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
410 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  26.54 
 
 
420 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  30.89 
 
 
410 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
416 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
416 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
416 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
417 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
417 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
417 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.27 
 
 
416 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  28.61 
 
 
396 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  27.4 
 
 
421 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 
404 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  26.04 
 
 
415 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  29.05 
 
 
398 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.78 
 
 
404 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  27.09 
 
 
402 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  27.4 
 
 
393 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.73 
 
 
397 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  27.86 
 
 
403 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  28.61 
 
 
420 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  27.86 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  28.21 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.04 
 
 
403 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  27.79 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  27.2 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.01 
 
 
403 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  31.55 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  25.89 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  24.93 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  25.83 
 
 
401 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  26.44 
 
 
423 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
419 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  29.01 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  27.41 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.51 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  29.6 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  25.71 
 
 
421 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  28.19 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.6 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  25.6 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  25.6 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  26.2 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  26.63 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2336  major facilitator transporter  31.44 
 
 
368 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  27.44 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  27.08 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
418 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  26.84 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  27.05 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.05 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  27.05 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1043  major facilitator transporter  30.34 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.75 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.96 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>