26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06042 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  33.11 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  25 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  37.61 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  35.56 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  30.36 
 
 		 389 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 418 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1343  putative transport protein  37.61 
 
 		 374 aa  45.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 402 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>