61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0094 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  791    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  20.8 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  21.36 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2558  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.0000197888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  24.78 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  23.1 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2156  major facilitator transporter  26 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  29.45 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  29.45 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.77 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.08 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  23.94 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0249  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.621086  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2125  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  26.12 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0263  major facilitator superfamily MFS_1  20.11 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0307  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0618  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  23.08 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1049  hypothetical protein  23.85 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0105777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0225  major facilitator transporter  20.26 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3522099999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  25.86 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  25 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  20.71 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.03 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  31.3 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  20.66 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  18.29 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  17.33 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  19.18 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>