70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1568 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1568  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  806    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0693  major facilitator transporter  99.51 
 
 
409 aa  803    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4235  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  28.24 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0600  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.04 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2155  hypothetical protein  29.32 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2019  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1999  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25 
 
 
383 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0062  hypothetical protein  33.04 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0321  major facilitator transporter  26.76 
 
 
402 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1138  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1077  hypothetical protein  23.62 
 
 
401 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3544  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2715  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146121  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.85 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  24.36 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  31.58 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  30.85 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  26.73 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0631  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  24.53 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.23 
 
 
469 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.37 
 
 
407 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3520  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
434 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  29.03 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
388 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.11 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  23.74 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  26.8 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  25.95 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  37.68 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3395  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  22.41 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.71 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.96 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  30.1 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.26 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  30.1 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  30.1 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  30 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.56 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 
449 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  32.63 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
420 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  32.63 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  32.63 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  32.63 
 
 
453 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  28.57 
 
 
438 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.4 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25 
 
 
396 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  31.15 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  21.4 
 
 
412 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  29.69 
 
 
462 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.5 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0637  major facilitator family transporter  34.25 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0786  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>