21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0322 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0322  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  794    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1823  major facilitator transporter  42.58 
 
 
464 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000162964  normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1814  major facilitator transporter  42.75 
 
 
456 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347664  hitchhiker  0.0000156838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1442  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
437 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07030  arabinose efflux permease family protein  32.67 
 
 
416 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0869  major facilitator transporter  29.52 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422831  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0873  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1915  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.488655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0235  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2349  major facilitator transporter  24.86 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0910  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.447265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3300  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.924206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0185  hypothetical protein  24.23 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  23.28 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06042  hypothetical protein  27 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  29.87 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  33.91 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2006  major facilitator transporter  24.1 
 
 
419 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2162  hypothetical protein  22.79 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000725543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>