More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2920 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2920  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 448 aa  857    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  0.655639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 501 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  33.61 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  29.38 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  31.58 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  29.97 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  29.92 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  30.21 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  27.93 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  24.04 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  25.7 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  26.45 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  26.27 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  23.92 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  23.92 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  23.92 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  23.92 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  26.3 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  23.8 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.97 
 
 		 449 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  23.8 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.71 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  25.67 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.63 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.63 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.63 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 427 aa  94.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.88 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  22.47 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  22.47 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  27.95 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>