More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3045 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  869    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  45.67 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 430 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  39.86 
 
 		 430 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 429 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  38.05 
 
 		 480 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  37.32 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  35.73 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 468 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  35.85 
 
 		 441 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  35.85 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  38.29 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  36.18 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.61 
 
 		 424 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 479 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.72 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.72 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  32.66 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.75 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  31.89 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  31.62 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  31.62 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  31.62 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  31.62 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  31.94 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.5 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  29.5 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.5 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.41 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  30 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.75 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  32.39 
 
 		 432 aa  183  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 430 aa  183  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  29.55 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  33.24 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  30.07 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  30.07 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  30.07 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  29.29 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  29.38 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  29.72 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  33.24 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  31.01 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>