More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11473 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  100 
 
 
424 aa  842    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  50.35 
 
 
428 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  46.24 
 
 
424 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 
434 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 
425 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  45.41 
 
 
432 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  44.34 
 
 
440 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  32.47 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
433 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  31.06 
 
 
433 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
433 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  33.33 
 
 
427 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  32.71 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  32.4 
 
 
434 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  32.4 
 
 
434 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  32.4 
 
 
434 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  32.4 
 
 
434 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
430 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
430 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
430 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  34.23 
 
 
435 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  31.67 
 
 
430 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  31.9 
 
 
430 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  31.9 
 
 
430 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  32.73 
 
 
430 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  32.99 
 
 
430 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  32.55 
 
 
429 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
426 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  34.58 
 
 
432 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  32.9 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.9 
 
 
423 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  29.03 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  32.44 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  28.7 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  29.15 
 
 
435 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
454 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
431 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  29.69 
 
 
433 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
436 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.06 
 
 
425 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.06 
 
 
425 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  27.71 
 
 
430 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.95 
 
 
434 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  29.95 
 
 
434 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.24 
 
 
443 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  29.95 
 
 
433 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  31.68 
 
 
411 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  30.05 
 
 
436 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
441 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  33.24 
 
 
423 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
453 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  28.74 
 
 
432 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  28.5 
 
 
433 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  28.03 
 
 
434 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  32.89 
 
 
423 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  32.89 
 
 
423 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  29.08 
 
 
433 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  29.58 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  29.67 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  29.01 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  29.01 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  29.81 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  27.87 
 
 
433 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  29.85 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
449 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.95 
 
 
427 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  30.67 
 
 
430 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  26.84 
 
 
441 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  31.28 
 
 
435 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  30.05 
 
 
457 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  29.45 
 
 
474 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
420 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  29.01 
 
 
432 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
432 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  29.67 
 
 
432 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  29.67 
 
 
432 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  29.67 
 
 
432 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  31.88 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  27.87 
 
 
433 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  31.15 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  30.22 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  31.55 
 
 
432 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
436 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
436 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
480 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  27.98 
 
 
441 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  27.02 
 
 
441 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  26.79 
 
 
442 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
415 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  28.15 
 
 
489 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  27.59 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  27.56 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.01 
 
 
436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>