177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3928 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  83.8 
 
 
440 aa  691    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
420 aa  821    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  67.54 
 
 
420 aa  506  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 
423 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 
423 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  50.73 
 
 
427 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
428 aa  340  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 
399 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  26.61 
 
 
429 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  26.37 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  25.45 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  35.03 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  31.54 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  26.67 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  28.96 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  25.26 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  26.08 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  24.62 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  33.08 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  31.65 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  29.45 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  35.25 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  34.71 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
396 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
449 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  26.88 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  29.27 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  28.93 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  31.17 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  26.55 
 
 
403 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  21.38 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.1 
 
 
474 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.1 
 
 
473 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.1 
 
 
474 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  25.68 
 
 
445 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.84 
 
 
439 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.1 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.54 
 
 
423 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  35.29 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  32.35 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.64 
 
 
417 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.2 
 
 
440 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  28.41 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.39 
 
 
476 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  24.27 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.39 
 
 
474 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  23.84 
 
 
439 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.52 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 
458 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
486 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
513 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  23.36 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  23.36 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  26.29 
 
 
406 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
452 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  28.37 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  26.37 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  26.37 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  23.93 
 
 
432 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  28.17 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.31 
 
 
532 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  26.71 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  27.03 
 
 
529 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  32.24 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
449 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.39 
 
 
472 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4228  hypothetical protein  33.81 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.06951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.58 
 
 
473 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.29 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>