More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0845 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  100 
 
 
434 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  100 
 
 
434 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  100 
 
 
434 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  100 
 
 
434 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  100 
 
 
434 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.67 
 
 
438 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.13 
 
 
438 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.78 
 
 
431 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  68.17 
 
 
431 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.53 
 
 
431 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.53 
 
 
431 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.7 
 
 
431 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  68.42 
 
 
432 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  69.53 
 
 
431 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  69.61 
 
 
433 aa  591  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  69.27 
 
 
433 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.12 
 
 
440 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.54 
 
 
431 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  70.67 
 
 
439 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.74 
 
 
440 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  71.03 
 
 
431 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.98 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  69.32 
 
 
430 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  65.32 
 
 
439 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  66.01 
 
 
454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.43 
 
 
432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  64.22 
 
 
437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.38 
 
 
433 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  62.82 
 
 
477 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  65.13 
 
 
435 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.14 
 
 
437 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  64.42 
 
 
431 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  64.81 
 
 
437 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  62.16 
 
 
425 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  63.44 
 
 
429 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  62.29 
 
 
433 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  63.46 
 
 
433 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  62.05 
 
 
433 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  64.27 
 
 
431 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  61.43 
 
 
431 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  65.02 
 
 
425 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  61.19 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  61.67 
 
 
431 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
431 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  61.19 
 
 
477 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
446 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  61.67 
 
 
431 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  61.19 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  63.61 
 
 
433 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  61.5 
 
 
430 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  60.48 
 
 
431 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  65.76 
 
 
435 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  60 
 
 
431 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  60.24 
 
 
431 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  63.48 
 
 
440 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  60 
 
 
488 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  62.65 
 
 
432 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  62.41 
 
 
430 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  61.43 
 
 
437 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  60.58 
 
 
429 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  61.3 
 
 
429 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  54.78 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  53.23 
 
 
430 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  38.18 
 
 
447 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
443 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  38.72 
 
 
425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  38.72 
 
 
425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  38.72 
 
 
425 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  38.75 
 
 
435 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  39.37 
 
 
425 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  37.77 
 
 
435 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  37.53 
 
 
435 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  38.2 
 
 
440 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  37.53 
 
 
435 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
438 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  39.13 
 
 
425 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
438 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  38.97 
 
 
425 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  37.77 
 
 
435 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  38.78 
 
 
425 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.22 
 
 
425 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
425 aa  279  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  39.71 
 
 
427 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  37.53 
 
 
435 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  38.54 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
427 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  38.5 
 
 
430 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.71 
 
 
435 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.04 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  37.44 
 
 
435 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
457 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>