More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1676 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  811    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  58.37 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  56.97 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  57.21 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  56.97 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.37 
 
 		 448 aa  346  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 446 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  47.39 
 
 		 442 aa  338  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 428 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  46.7 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  41.8 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  34.64 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.36 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.28 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.98 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.63 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  22.63 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  29.3 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.69 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  24.32 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.69 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.32 
 
 		 431 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.72 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  25.83 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  25.83 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  25.87 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.84 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  27.39 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  27.39 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  30.49 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.53 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  30.49 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.49 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.49 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.41 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  25.18 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  23.41 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  28.33 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.4 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  27.92 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.4 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.19 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  24.36 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  20.98 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  28.45 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  25.96 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  25.96 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  23.74 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  23.74 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>