More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2835 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  826    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  61.8 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  46.67 
 
 		 418 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 437 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  45.52 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 		 441 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  44.66 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  41.85 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  43.61 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  38.12 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.26 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25.26 
 
 		 430 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  29.59 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.56 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.56 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  29.32 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  26.36 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.7 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.44 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.02 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.88 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.69 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 434 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.06 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.19 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.25 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.13 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 417 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.25 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  22.37 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  29.11 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 417 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.68 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  27.78 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.04 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.84 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  24.72 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.44 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.93 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  25.48 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  33.11 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  31.08 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  29.73 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  31.33 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  31.33 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.24 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  26.36 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  26.36 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.93 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>