250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0829 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
430 aa  805    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 
447 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
446 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 
448 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 
443 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  41.72 
 
 
442 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 
423 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  40.78 
 
 
418 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  41.32 
 
 
437 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  42.82 
 
 
442 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  43.47 
 
 
398 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  42.12 
 
 
447 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
438 aa  262  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  41.56 
 
 
426 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  41.56 
 
 
426 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  40 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  38.82 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
441 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
486 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
439 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  42.62 
 
 
460 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  38.62 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
411 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  26.78 
 
 
366 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  26.5 
 
 
366 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.93 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.52 
 
 
430 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.68 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.27 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 
439 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 
432 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.25 
 
 
432 aa  86.3  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.94 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.63 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.07 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.8 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.16 
 
 
430 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.37 
 
 
430 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.44 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.44 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.17 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.39 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  25.19 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  24.71 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  25.19 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.93 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.97 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  25.71 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.52 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.03 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.21 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.52 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  21.71 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  20.85 
 
 
452 aa  67  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  20.85 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.99 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.25 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  37.85 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  37.85 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.37 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
446 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  26.18 
 
 
432 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.18 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.99 
 
 
426 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  26.45 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.09 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  36.52 
 
 
405 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  36.52 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.25 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  25.9 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  35.96 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  35.96 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  34.81 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.79 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.12 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
431 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.45 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  38.1 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  31.82 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  22.22 
 
 
440 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  23.31 
 
 
415 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
407 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  34.85 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.68 
 
 
427 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  21.59 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.38 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>