More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  100 
 
 		 446 aa  846    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  60.09 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 486 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  40.49 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  45.02 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  42.67 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 442 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 423 aa  262  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 447 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  39.34 
 
 		 442 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 423 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  39.54 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  38.99 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 417 aa  126  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25.94 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25.94 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25.13 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25.39 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.76 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.12 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.12 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  28.84 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  26.54 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  31.29 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  26.27 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.28 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.44 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  25.81 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.04 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.04 
 
 		 430 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  24.74 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.75 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.75 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.74 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.86 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.84 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  28.07 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  23.74 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.8 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  26.13 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.13 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  25.08 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  25.08 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.62 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  24.57 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  23.37 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  22.72 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  24.38 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.02 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.89 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>