More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1989 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 397 aa  169  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  34.66 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  32.7 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  29.75 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.18 
 
 		 420 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.11 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  27.12 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  32.66 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  27.12 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  30.34 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  34.84 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 425 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 420 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  30.62 
 
 		 450 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 433 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.58 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  28.92 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  28.65 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  31.02 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  29.05 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.73 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  29.66 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  28.19 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.4 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.73 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.94 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.4 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  30.1 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  30.06 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  23.63 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.06 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  25.53 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  25.53 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  30.96 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  29.06 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  30.46 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  28.63 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.28 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.28 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.28 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.87 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  29.58 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>