More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5436 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
411 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  50.98 
 
 
430 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  39.52 
 
 
398 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
438 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
443 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 
446 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  37.66 
 
 
442 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  36.15 
 
 
428 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  37.53 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
439 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  36.51 
 
 
442 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  34.06 
 
 
418 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  34.24 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  35.62 
 
 
447 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
447 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  37.43 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
423 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  34.51 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  34.51 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
430 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.32 
 
 
445 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.01 
 
 
432 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.49 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
437 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.82 
 
 
434 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  23.63 
 
 
434 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.17 
 
 
434 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
441 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  32.4 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  31.33 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  31.33 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  29.57 
 
 
432 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
439 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  34.62 
 
 
418 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  28.89 
 
 
430 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  31.32 
 
 
434 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.22 
 
 
443 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  28.15 
 
 
430 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.15 
 
 
443 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  32.58 
 
 
428 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.08 
 
 
432 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  26.17 
 
 
426 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.39 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.68 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.82 
 
 
430 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.82 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  31.15 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.52 
 
 
432 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.52 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  29.27 
 
 
443 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.75 
 
 
414 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
392 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  28.29 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  27.81 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  27.12 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  23.59 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  23.59 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  27.51 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  24.1 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  27.51 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  38.03 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.52 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  30.57 
 
 
461 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.93 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  22.3 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  33.5 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.9 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  28.05 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  25.91 
 
 
437 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31.89 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  32.21 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.31 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  28.78 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  29.13 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25.1 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.65 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25.59 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  23.66 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  32.39 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  27.14 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>