More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1446 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  810    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 425 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.31 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  34.37 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  34.37 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  34.37 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  34.37 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  34.37 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  34.37 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  34.37 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  33.7 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  31.36 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.43 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  28.9 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 410 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  29.83 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  30.99 
 
 		 493 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.86 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.86 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 417 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  22.87 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  21.79 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  21.79 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.43 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  29.28 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.46 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.72 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.91 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.4 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.4 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.14 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.59 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  29 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  21.43 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.29 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  21.49 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  21.43 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.19 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.19 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.64 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  24.29 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>