More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0296 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  100 
 
 
431 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  73.75 
 
 
423 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  61.39 
 
 
415 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  61.46 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  61.22 
 
 
412 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  62.99 
 
 
493 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  36.01 
 
 
405 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  35.82 
 
 
407 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
431 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.31 
 
 
412 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  31.15 
 
 
415 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  30.27 
 
 
407 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  39.08 
 
 
461 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  32.56 
 
 
425 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  32.49 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.16 
 
 
420 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 
392 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  32.99 
 
 
420 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  29.28 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  30.1 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.8 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  28.45 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  29.53 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  28.77 
 
 
412 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  29.53 
 
 
430 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  29.53 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  30.49 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  29.66 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.66 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  29.02 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  29.53 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
415 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.11 
 
 
414 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  29.23 
 
 
405 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
411 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.5 
 
 
417 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  28.72 
 
 
405 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  28.72 
 
 
405 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.68 
 
 
418 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
425 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  29.21 
 
 
416 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
413 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.52 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.09 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.27 
 
 
433 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.4 
 
 
445 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.15 
 
 
428 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  27.63 
 
 
389 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  29.24 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.49 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.01 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  25.13 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  27.27 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  27.07 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.62 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.83 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.97 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.76 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  29.21 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  26.75 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  25.97 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  28.25 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.89 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  25.16 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  25.16 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  26.51 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.45 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  27.44 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.72 
 
 
430 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
446 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.72 
 
 
430 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  27.27 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.66 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.04 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2676  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.4 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
438 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  29.1 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.58 
 
 
428 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  25 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.1 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.54 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  25.69 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>