249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0041 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  98.97 
 
 		 390 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  87.95 
 
 		 390 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  53.32 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  34.4 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  34.08 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.37 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  30.65 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  32.39 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 434 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  28.65 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  34.3 
 
 		 493 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 420 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 446 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.2 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  31.76 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  31.76 
 
 		 430 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  31.76 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 431 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.81 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  30.21 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.74 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.73 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.28 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.29 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.46 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.12 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.12 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  25.75 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.11 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.64 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.57 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.79 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>