More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0480 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 395 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  68.63 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  68.9 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  54.75 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  62.31 
 
 		 409 aa  362  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  56.15 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  55.27 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  55.53 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.59 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  27.81 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  27.07 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 415 aa  99.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.25 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.78 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.23 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.57 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.83 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.15 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.15 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  28.35 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  23.87 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  30.25 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.01 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  27.56 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.08 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  26.69 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.64 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.64 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.1 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  28.64 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.13 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  29.78 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  29.78 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.55 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  27.69 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  27.69 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  22.91 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>