More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0872 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  79.66 
 
 
413 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  79.18 
 
 
413 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  78.2 
 
 
405 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  77.19 
 
 
405 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  77.69 
 
 
405 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  77.69 
 
 
405 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  77.15 
 
 
412 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  77.15 
 
 
430 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  77.15 
 
 
412 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  77.15 
 
 
412 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  77.15 
 
 
412 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  77.15 
 
 
430 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  77.15 
 
 
412 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  77.23 
 
 
412 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  76.47 
 
 
410 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  75.49 
 
 
410 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  74.26 
 
 
410 aa  524  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  57.57 
 
 
425 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  54.57 
 
 
418 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  39.34 
 
 
405 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  36.43 
 
 
427 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  36.46 
 
 
420 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  36.65 
 
 
420 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  34.62 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  37.25 
 
 
407 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30.15 
 
 
415 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
431 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.66 
 
 
407 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  33.42 
 
 
416 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  36.13 
 
 
461 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.54 
 
 
412 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
392 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
415 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  33.06 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 
493 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 
412 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.5 
 
 
445 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.45 
 
 
431 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.68 
 
 
428 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.1 
 
 
414 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
413 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.99 
 
 
432 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.33 
 
 
434 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.24 
 
 
434 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.43 
 
 
390 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.58 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.47 
 
 
390 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.56 
 
 
410 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.91 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.26 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  22.56 
 
 
410 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
446 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  29.06 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.59 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24 
 
 
417 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  22.28 
 
 
430 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  22.28 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.5 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.18 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  26.39 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  28.06 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  25.33 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  28.03 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  25.33 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.98 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.96 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  26.62 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.69 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  28 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.05 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.76 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.1 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.1 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  21.76 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.14 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.28 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.75 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  25.52 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.98 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.41 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  28.46 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  28.46 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>