More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0294 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  99.27 
 
 		 412 aa  793    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 412 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  63.77 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  61.46 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  61.37 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  58.82 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  34.79 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  31.02 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  30 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  39.33 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  32.2 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  33.99 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  32.2 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  33.99 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  32.34 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  34.08 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  32.34 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.85 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  26.15 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  30.54 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0963  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.73 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.94 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  27.43 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  27.13 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.88 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.58 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.58 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.02 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  24.52 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  23.68 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  23.68 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  27.31 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  25.9 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  25 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.78 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.91 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  30.67 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.17 
 
 		 448 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  26.89 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  30.22 
 
 		 451 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>