More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1524 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  835    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  41.16 
 
 
417 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  39.22 
 
 
428 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  34.29 
 
 
432 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  34.29 
 
 
432 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  37.89 
 
 
434 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  33.25 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  32.85 
 
 
430 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  32.85 
 
 
430 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
441 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  34.2 
 
 
426 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  34.13 
 
 
426 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  33.49 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  33.01 
 
 
437 aa  199  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
421 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  32.95 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  32.95 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  34.22 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  33.96 
 
 
432 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  31.46 
 
 
422 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  31.46 
 
 
427 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  32.16 
 
 
443 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  32.39 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.81 
 
 
434 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  30.12 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.58 
 
 
434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  29.88 
 
 
428 aa  173  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  32.98 
 
 
425 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  32.98 
 
 
425 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  28.94 
 
 
443 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
437 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  30.27 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
439 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  30.02 
 
 
428 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  28.05 
 
 
446 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  28.05 
 
 
446 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  30.77 
 
 
432 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  30.29 
 
 
434 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  29.97 
 
 
452 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
452 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  29.46 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
439 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  31.49 
 
 
417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  31.39 
 
 
418 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  26.9 
 
 
431 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
425 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.21 
 
 
431 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  29.32 
 
 
451 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.95 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.68 
 
 
406 aa  127  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
423 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  29.69 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  33.33 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  31.91 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.34 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  32.23 
 
 
447 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  31.84 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  30.42 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.94 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  26.18 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.06 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.8 
 
 
410 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  25.46 
 
 
411 aa  111  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  30 
 
 
437 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.47 
 
 
412 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  28.94 
 
 
418 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
438 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
441 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  24.94 
 
 
411 aa  107  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  28.88 
 
 
420 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  30.07 
 
 
442 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  30.12 
 
 
398 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  30.91 
 
 
426 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  25.78 
 
 
399 aa  104  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  30.91 
 
 
426 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  25.49 
 
 
366 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
443 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31.62 
 
 
407 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  25.21 
 
 
366 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  29.09 
 
 
441 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.45 
 
 
420 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  27.59 
 
 
442 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
486 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  32.19 
 
 
418 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
431 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.78 
 
 
418 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  28.14 
 
 
460 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>