More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0113 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 407 aa  783    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  99.02 
 
 		 407 aa  775    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  70.93 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  69.45 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  61.02 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  60.75 
 
 		 420 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 409 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 407 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.49 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  30.06 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.96 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  29.71 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.94 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  29.6 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  29.6 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  29.82 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.28 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.28 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 434 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  30.71 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 417 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  25 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 425 aa  86.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  30.92 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.68 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  21.68 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  26.8 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  21.79 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  21.51 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  21.57 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  27.83 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.67 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.14 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.14 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>