More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5613 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  100 
 
 		 432 aa  859    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  74.12 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  59.43 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  34.31 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  30.06 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  26.75 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  28.7 
 
 		 415 aa  90.5  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.68 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.12 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  30.08 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  26.74 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28.42 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.69 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  25.11 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  27.85 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  24.65 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.68 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.1 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  24.08 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  26.89 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25.75 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  24.64 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.69 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  27.15 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  28.73 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.37 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  27.69 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.04 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  27.57 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  27.69 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>