More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1178 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  88.09 
 
 		 405 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  87.8 
 
 		 410 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  90.07 
 
 		 405 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 405 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  97.07 
 
 		 410 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 405 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  72.41 
 
 		 413 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  75.49 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  75.49 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  75.49 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  75.49 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  75.49 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  75.49 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  75.74 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  75.49 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  75.49 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  73.68 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  57.74 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  39.15 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 427 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.11 
 
 		 420 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.9 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  39.32 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  33.81 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  31.82 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  31.93 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 395 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  30.48 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.81 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  21.02 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  20.12 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.04 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.34 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.34 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  29.54 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.77 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.97 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  26.38 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.05 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.15 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.02 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.73 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  26.15 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.3 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  26.15 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  34.44 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  34.44 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  32.52 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>