More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0604 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  847    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  99.29 
 
 
427 aa  844    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  35.51 
 
 
430 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  35.75 
 
 
430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  36.01 
 
 
432 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  36.01 
 
 
432 aa  256  6e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  34.52 
 
 
430 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  34.53 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  34.3 
 
 
426 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  34.3 
 
 
426 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  32.77 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  32.77 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  31.05 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  30.24 
 
 
443 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  30.24 
 
 
443 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  33.66 
 
 
437 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  29.61 
 
 
426 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  31.07 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  30.83 
 
 
428 aa  189  8e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.46 
 
 
434 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  32.92 
 
 
437 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  30.79 
 
 
423 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  30.4 
 
 
428 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  30.54 
 
 
423 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.82 
 
 
452 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.82 
 
 
452 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
428 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  30.68 
 
 
417 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  30.33 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
439 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  28.12 
 
 
446 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
446 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  29.78 
 
 
384 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  30.34 
 
 
441 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  28.23 
 
 
451 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.13 
 
 
428 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  28.8 
 
 
366 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  27.18 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  29.87 
 
 
434 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.87 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  29.06 
 
 
432 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.11 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  27.64 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.91 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  27.64 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  27.51 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  28.43 
 
 
434 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  27.98 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.69 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  24.43 
 
 
410 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  25.65 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.25 
 
 
406 aa  114  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  24.14 
 
 
411 aa  107  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  32.68 
 
 
430 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  29.56 
 
 
405 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25.3 
 
 
417 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
439 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
437 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
415 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.94 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
446 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25.65 
 
 
429 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  29.44 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.21 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  26.68 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.12 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  31.28 
 
 
461 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  23.65 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.87 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
411 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.61 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  25.07 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.78 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.94 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  20.25 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  25.45 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  27.68 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1033  permease, putative  24.75 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.187473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  23.67 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  26.02 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  24.93 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  23.91 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>